革命性的新方法可以操纵DNA的形状和包装:研究

华盛顿[美国]6月16日(ANI):一个人类细胞含有大约2米长的DNA,其中包含了一个人重要的遗传信息。如果一个人体内包含的所有DNA都被解开并展开,它将覆盖一个惊人的距离——足以到达太阳并返回60次。细胞将DNA压缩成密集排列的染色体,以管理如此大量的生物信息。
“把DNA想象成一张纸,上面写着我们所有的遗传信息。”共同通讯作者Minke A.D. Nijenhuis说。“这张纸被折叠成一个非常紧密的结构,以便将所有信息放入一个小细胞核中。然而,为了阅读信息,必须将部分纸张展开,然后再折叠。我们遗传密码的这种空间组织是生命的核心机制。因此,我们希望创造一种方法,使研究人员能够设计和研究双链DNA的压缩。”
天然DNA通常是双链的,一条链编码基因,另一条链作为备份,在双螺旋结构中相互交织。沃森-克里克相互作用使两条链相互识别并配对,稳定了双螺旋结构。然而,还有另一类鲜为人知的DNA相互作用。这些接触被称为正常或反向胡格斯汀相互作用,允许第三条链加入,形成令人惊叹的三螺旋结构。
在最近发表在《先进材料》杂志上的一篇论文中,来自Gothelf实验室的研究人员首次提出了一种基于Hoogsteen相互作用的组织双链DNA的通用方法。该研究明确表明,三联体形成的链能够急剧弯曲或“折叠”双链DNA,以创建紧凑的结构。这些结构的外观范围从中空的二维形状到密集的3D结构,以及介于两者之间的一切,包括类似于盆花的结构。Gothelf和同事将他们的方法命名为三重折纸。
有了三重折纸,科学家们可以实现对双链DNA形状的人工控制,这是以前无法想象的,从而开辟了新的探索途径。最近有人提出,三重结构在遗传DNA的自然压实中起作用,目前的研究可能为这一基本生物学过程提供见解。
这项工作还表明,hoogsteen介导的三层结构保护DNA免受酶降解。因此,用三重折纸方法压缩和保护DNA的能力可能对基因治疗有很大的意义,其中患病细胞通过将其缺失的功能编码到可交付的双链DNA片段中来修复。
这种DNA序列和结构的生物学奇迹也被应用于纳米材料工程,在治疗、诊断和许多其他领域产生应用。“在过去的四十年里,DNA纳米技术几乎完全依靠沃森-克里克碱基相互作用来配对单个DNA链,并将它们组织成定制的纳米结构。”Kurt V. Gothelf教授说。“我们现在知道Hoogsteen相互作用具有组织双链DNA的相同潜力,这为该领域带来了重大的概念扩展。”
Gothelf和同事证明hoogsteen介导的折叠与最先进的基于沃森-克里克的方法兼容。然而,由于双链DNA的相对刚性,三重折纸结构需要较少的起始材料。这使得更大的结构可以以更低的成本形成。
新方法的局限性在于,三联体的形成通常需要在双链DNA中延伸很长的嘌呤碱基,因此研究人员使用了人工DNA序列,而不是天然遗传DNA。然而,在未来,他们将努力克服这一限制。(ANI)